机甲大战变种异煞，正式开战。

2044年的纽约，大反派朗格勾结外星恶势力试图毁灭地球，大量外星人通过神秘传送门入侵，将城市化为灰烬。忍者神龟们虽负隅顽抗仍不敌敌人攻势，死伤惨重。怀抱着忍者最强武器——希望，忍者神龟们决定回到过去时空，找到开启传送门的钥匙，阻止朗格，恢复世界和平。里奥纳多的弟子凯西肩负起这一使命，他在过去时空与女记者艾普利尔·奥尼尔成功接头，并和忍者神龟们汇合，开启了拯救世界的行动。“我们的未来，我们自己做主”忍者神龟们向朗格发起了终极挑战。

伊莎要为举行街头派对进行筹款，但她无意间发现，街头派对策划人康多拉的现男友竟然是自己的前男友罗伦斯。康多拉得知这件事也很无奈，她不知道是放弃与伊莎继续合作，还是要和罗伦斯分手。在筹款当天康多拉还是来到了现场主持大局，而伊莎也觉得俩人的关系从互相欣赏变得有些别扭，但她们俩人还是认真地投入工作中。