最后一场战斗已经过去两年了，世界各地已经恢复了和平。然而，当怪物再次开始出现在地球上时，事情并没有平静多久。与此同时，一系列神秘的闯入事件发生在世界各地的超级古代遗迹中。GUTS-SELECT团队由新队长带领，准备展开调查。殊不知，这是一场生死未卜的激战之始。GUTS-SELECT和泽塔奥特曼在真中剑悟的带领下加入战斗。一个邪恶的身影从阴影中出现：邪恶特利迦，一个继承暗影的邪恶巨人。为了让大家再次展露微笑，特利迦奥特曼和泽塔奥特曼的人间体夏川遥辉与GUTS-SELECT的新成员以及黑暗特利迦的人间体伊格尼

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泼水节上，从监狱放出来的杀手完成任务后，还要回到监狱中。警察弗朗西斯来见岳父，碰到了帕切科将军，他得知他们是害死他人的凶手，而岳父希望他利用其职务帮忙掩盖真相。波尔遇害前告知警察艾克斯达，自己以前在监狱里负责给老板提供罪犯，用来帮助帕切科将军杀人。弗朗西斯一路追查，发现其父死在帕切科手中，于是假意顺从，想套取对方犯罪的证据，却被其雇佣的杀手杀死。弗朗西斯的录音，令帕切科陷入舆论争议，但没有被定罪。阿涅的报社因刊登关于市长尤西比奥的负面新闻受到打压，他与朋友西索发生争吵。阿涅遇害后，西索通过他留下的录音笔，