1969年，人类获得了名为科学的伟大之力。一方面，为了破坏而进行军备扩充，另一方面，为了生产而迈进经济发展，人类处于矛盾之中。而这时，未知的敌人抓住了矛盾，“侵略者”出现了。为了对抗侵略者，人类在背地秘密组成了地球防卫机构AEGIS。在联合国的指挥下，他们作为地球防卫的最后防线，集结了一群拥有特殊能力的战士“捍卫者”。一天，极其平凡的高中生浮矢瞬，其沉睡中的捍卫者能力被AEGIS发现了。然后，他被任命为特殊游击队队长。在少年的能力苏醒之时，新的战斗故事开始了。

不打官司好多年的哈佛大学法律系知名教授Paul Armstrong（Sean Connery）这日收到一封鸣冤信：佛罗里达州一名女孩被人绑架谋杀，警方将黑人大学生Bobby（Blair Underwood）视作凶手，并在缉拿后严刑逼供令其签字画押，前途光明的年轻人只因是黑人变作死囚。　　Paul被信件打动，决定重出江湖为Bobby辩护。一番缜密调查，Paul找到足以还Bobby清白之躯的证据，但他没有想到，一切均系Bobby的精心策划，自己及家人才是他的真正目标

两位特殊部队的队员坐在运输机内，盯着监控的屏幕。突然一声警报响起，系统检测到有怪兽出现。这时候特殊部队队员比留间弦人下达了新的指令，弦人命令所有人按照预案去指定地点集合。一头来自宇宙的怪兽甲壳怪兽从天而降，巨大的冲击力给城市带来了很大的破坏。地面防卫部队与怪兽展开了激烈交战。怪兽的肆意破坏摧毁了很多大楼，怪兽出现的地方化为了一片火海。弦人为了拯救还没有逃出的群众，独自冲入火海救人。弦人在救人过程中出现意外，关键时刻他体内涌现出一道神秘的光。新的奥特曼就此诞生了，新的奥特曼不光救下了弦人队长，还打败了怪兽。